Using the Iso-Seq Method For Bulk and Single-Cell Isoform Sequencing

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 日期:    2021年03月03日(周三)
 時間:    10:00 a.m.-11:30 a.m.(臺北時間)

 

Speaker:

PacBio 公司獨家研發的 RNA 全長定序技術Iso-Seq (Isoform sequencing). 兼具有高準確度 (>99.9%) 與長讀取 (~10 kb) 特性,幾乎不需組裝即可自 Iso-Seq 測序結果中直接讀取到轉錄產物 (transcripts) 的全長序列,精確地呈現各個選擇性剪接 (alternative splicing) 轉錄異構物 (transcript isoforms) 的外顯子 (exon) 組合樣貌!在最新的 Sequel IIe 定序系統上,一片SMRT Cell 8M 定序晶片、再搭配後端成熟的官方與社群開發分析工具,即足以詳盡地描繪出整個轉錄體 (transcriptome) 的完整樣貌。

透過此演講,您將會了解到:

  • Iso-Seq 定序原理
  • Iso-Seq 應用實例:發現癌症融合基因 (fusion genes in cancers)
  • Iso-Seq 應用實例:六倍體紅杉 (coastal redwood) 的異構物定相分析 (isoform phasing)
  • Iso-Seq 應用實例:單細胞選擇性剪接轉錄異構物的發現與分析

Elizabeth Tseng, Ph.D.
Principal Scientist
PacBio

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