使用单分子实时测序对幼儿龋齿中的口腔微生物群落进行分析
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日期: 2019 年 10 月 25 日
时间: 10:00-11:00 a.m.(北京)
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个人简介:
短读长测序以其高通量及价格优势在各研究领域得到广泛应用。然而,现有的短读长测序虽然能快速给出庞大的数据量,但因为其只有200-300bp的长度,为后续基因的组装及预测带来了困难。如何兼顾高通量和读长长的优势?PacBio SMRT测序以其长读长及高准确性为我们的研究提供了新的技术手段。我们的前期研究数据表明,相对于短读长测序,PacBio SMRT测序可以对口腔微生态中物种16S rRNA全长进行测序。在种水平上,有超过50%的物种在短读长测序平台上无法被精确分辨,而SMRT测序无法鉴定的物种比例仅有0.03%。因此,相对于短读长测序,SMRT测序在种属水平有更高的物种分辨率。来自浙江大学医学院附属口腔医院的王媛博士将与我们分享她的研究结果,分别选取高龋/无龋儿童,利用PacBio SMRT测序技术探索口腔微生物的差异在儿童龋病发生过程中的作用。
当您了解 PacBio SMRT测序时,我们期待您的参与!
王媛,博士
主治医师
浙江大学医学院

